由巨人支配的世界，人們的安穩生活已然瓦解。「一具不留的全殺光」與如此強烈的心意背道而馳、突然化身為巨人的主角艾連在不知自己來歷的內心糾葛下、艾連打算利用自己這股能力來拯救人類。有些人尊崇他為「救世主」，有些人畏懼地視他為「惡魔」，但緊接著出現在他面前的卻是明顯與他不同、擁有智慧的女巨人，究竟她又是什麼來歷……而艾連體內又潛藏有什麼樣神秘的能力……